土地增值税不记入成本，土地增值税不属于购买环节的税金，不计入成本。通常情况下，只有购买环节发生的、与资产的购买直接相关的税费，如契税、耕地占用税、车辆购置税等，才会计入相关资产的价值中。
1、一般企业转让的土地使用权连同地上建筑物及其附着物一并在“固定资产”等科目核算的，转让时应交的土地增值税：
借：固定资产清理。
贷：应交税费——应交土地增值税。
2、一般企业土地使用权在“无形资产”科目核算的，转让时按实际收到的金额：
借：银行存款累计摊销。
贷：无形资产应交税费——应交土地增值税营业外收入（或借：营业外支出）。
3、兼营房地产业务的企业，应由当期负担的土地增值税，通过“其他业务成本”科目核算：
借：其他业务成本。
贷：应交税费——应交土地增值税。
4、房地产开发企业，应该将土地增值税记入“营业税金及附加”科目：
借：营业税金及附加。
贷：应交税费——应交土地增值税。
土地增值税指的就是转让国有土地使用权土地上的建筑物及其附着物，并取得收入的单位及个人用来转让所得到的收入，收入中都包含了货币收入，实物收入或者是其他收入减掉法定扣除的项目金额之后的增值额为计税依据需要向国家缴纳的一种税赋，但不包括以继承或赠与方式无偿转让房地产的行为。增值税就是以商品还有应税劳务在流转的过程中产生的增值额作为计税依据的征收的一种流转税。从计税的原理上来讲，增值税是对于商品生产流通劳务服务中多个环节新增价值或者是商品的附加值征收的一种流转税。
《中华人民共和国土地增值税暂行条例实施细则》（财法字[1995]6号）第七条规定，条例第六条所列的计算增值额的扣除项目，具体为：（五）与转让房地产有关的税金，是指在转让房地产时缴纳的城市维护建设税、印花税。因转让房地产交纳的教育费附加，也可视同税金予以扣除。
根据上述法规规定，清算土地增值税时可以扣除的税费包括：城建税、教育费附加、地方教育费附加，但是不包括增值税、企业所得税。
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