小规模纳税人购进材料或者支付费用时，如果不能拿到对应的发票，企业应该按实际发生的业务和原始单据先据实入账，只是该项成本费用的支出，没有取得合规的票据，不能在税前扣除。处于这种情况的小企业，建议去税务局申请核定征收。
小规模企业做账要按下面步骤操作：
1、根据原始凭证登记记账凭证，月末或定期编制科目汇总表登记总账。
2、每月发生一笔业务就根据记账凭证登记明细账。
3、月末要提取折旧待摊费用的摊销等。
4、月末编制完科目汇总表之后编制两个分录。
5、第一个分录将损益类科目的总发生额转入本年利润，借主营业务收入，贷本年利润。第二个分录借本年利润贷主营业务成本。
6、最后根据总账的资产，负债，所有者权益，科目的余额编制资产负债表和利润表。
7、其余的就是装订凭证，写报表附注，分析情况表之类。
小规模纳税人取得了增值税专用发票的话，就作为普通发票用来入帐就可以了，将抵扣联和发票联一起入作为备查，不能进行抵扣，这是为了以防对方增值税一般纳税人如果发现或被查出开错发票,到时会调查用。
根据《国家税务总局关于纳税人认定或登记为一般纳税人前进项税额抵扣问题的公告》(国家税务总局公告2015年第59号)的规定，纳税人自办理税务登记至认定或登记为一般纳税人期间，未取得生产经营收入，未按照销售额和征收率简易计算应纳税额申报缴纳增值税的，其在此期间取得的增值税扣税凭证，可以在认定或登记为一般纳税人后抵扣进项税额。
实际操作中，一个企业，除非已经停业了，或者暂时歇业，才会没有成本的。大多数时候，并不是没有成本，只是成本没有取得发票。这种情况下，在会计上面，仍然是按正常的会计分录来处理。比如购买的商品，销售出去了，取得了对应的收入，但是购进的时候没有发票。则购进的时候，
借：库存商品，
贷：银行存款等。
结：转成本的时候，
借：主营业务成本，
贷：库存商品。
只是这个没有发票，汇算清缴的时候不能税前扣除。
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