小规模企业的增值税一般是按季度申报的，在每个月入账确认收入的时候，是不能确认该项业务对应的增值税及附加税是不是减免的。所以都需要先计提，在季度末的时候根据该季度的收入情况和开票情况来确认是不是要缴纳附加税，不需要缴纳的时候，在转入营业外收入-税收减免。所以建议还是计提。
水利建设基金是专项用于水利建设的政府性基金。水利建设基金应按照销售收入来计提和交纳。各省市的征收比例各不相同。小规模水利建设基金每个地方有差异，一般是按收入的千分之一到千分之三进行收取，其账务处理为，
（1）计提时：
借： 税金及附加，
贷： 应交税费—地方水利建设基金。
（2）缴款时：
借：应交税费—地方水利建设基金，
贷：银行存款/营业外收入—税费减免。
非居民企业符合条件享受附加税减免。
财税[2016]12号 财政部 国家税务总局关于扩大有关政府性基金免征范围的通知
教育部、水利部, 各省、自治区、直辖市、计划单列市财政厅（局）、国家税务局、地方税务局、新疆生产建设兵团财务局：
经国务院批准，现将扩大政府性基金免征范围的有关政策通知如下：
一、将免征教育费附加、地方教育附加、水利建设基金的范围，由现行按月纳税的月销售额或营业额不超过3万元（按季度纳税的季度销售额或营业额不超过9万元）的缴纳义务人，扩大到按月纳税的月销售额或营业额不超过10万元（按季度纳税的季度销售额或营业额不超过30万元）的缴纳义务人。
一般纳税人享受附加税减免。
财税[2016]12号 财政部 国家税务总局关于扩大有关政府性基金免征范围的通知
教育部、水利部, 各省、自治区、直辖市、计划单列市财政厅（局）、国家税务局、地方税务局、新疆生产建设兵团财务局：
经国务院批准，现将扩大政府性基金免征范围的有关政策通知如下：
一、将免征教育费附加、地方教育附加、水利建设基金的范围，由现行按月纳税的月销售额或营业额不超过3万元（按季度纳税的季度销售额或营业额不超过9万元）的缴纳义务人，扩大到按月纳税的月销售额或营业额不超过10万元（按季度纳税的季度销售额或营业额不超过30万元）的缴纳义务人。
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