1、首先，下载自然人税收管理系统扣缴客户端。
2、进入客户端主界面，点击人员信息采集，主录入员工的姓名、身份证号，入职日期等。再点击专项扣除信息采集，这个主要是采集员工的六项扣除信息。
3、做好资料录入后，点击综合所得申报。
4、进入综合所得申报界面，点击正常工资薪金所得后面的填写。
5、进入个税工资填写界面，选择添加或者导入，就是添加或者导入员工的信息资料。
6、资料导入后，页面中间会弹出员工的信息，本期收入都填写零。填写好之后，点击页面右上角的提交数据。
7、返回到综合申报主界面，点击税款计算。页面弹出密码输入框，输入申报密码，点击确定。
8、页面跳转到综合申报主界面，点击申报表报送，再点击发送申报即可完成个税零申报了。
2019个税申报是自行申报，扣缴义务人每月所扣的税款，自行申报纳税人每月应纳的税款，都应当在次月15日内缴入国库，并向税务机关报送纳税申报表。工资、薪金所得应纳的税款，按月计征，由扣缴义务人或者纳税义务人在次月15日内缴入国库，并向税务机关报送纳税申报表。两处或者两处以上取得工资、薪金收入的纳税人，在实行单位代扣代缴的同时，纳税人应将其多处取得的“工资、薪金收入”合并按税法规定扣除一次费用。
个税申报与实际不符：
个税申报与实际不符要先看个人所得税申报系统申报金额正确还是实际发放金额正确，如果申报金额正确的话，要调整账务处理补计提工资，如果是实际发放金额正确的话，要更正个人所得税申报，按照正确的金额申报。
个税零申报后，如果发现申报错误，可以更正申报。
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